赋能种业振兴！华大自主平台单G 9.99元助力农业种质资源普查

政策 · 看点 

农业种质资源是国家战略性资源，是种业创新的基础，事关种业振兴全局。2021年中央一号文件提出“打好种业翻身仗”，再次明确了种业的基础性、战略性地位。打好种业翻身仗、加快推进种业振兴最根本的一点就是要全面加强种质资源保护利用，加大资源普查力度，及时将新发现的资源保护起来。2021年3月，我国启动新中国历史上规模最大的农业种质资源普查。

测序技术的飞速发展使得几乎所有重要物种的参考基因组序列已经构建完成，测序通量的提高及成本下降，大规模的种质资源普查已如火如荼。

近几年，众多大型种质资源的普查研究已发表。

2018年12月，德国莱布尼茨植物遗传学和作物研究所等单位在Nature Genetics报道了对来自多个国家基因库保存的22,626份大麦种质资源进行了GBS测序和分析，揭示了基因库基因组学可以作为一种种质资源收集管理的工具。

2019年9月，国际玉米和小麦改良中心等单位在Nature Genetics报道了对CIMMYT在全球小麦育种计划中使用的44,624份小麦种质资源材料进行了GBS测序和分析，揭示了利用基因组学工具可以加速重要性状的遗传改良。

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基因科技赋能

种质研究结硕果

多年来，华大基因作为全球领先的科学技术服务机构，主导和参与过大量的大规模动植物种质资源研究计划，在种质资源的测序和分析方面积累了大量的经验，同时造就了一批科研合作的专业人才。

2018年4月，中国农业科学院，国际水稻研究所和华大基因等单位合作的3,010水稻基因组计划文章发表于Nature，该项目产生测序数据17T，平均测序深度14X，针对水稻起源、分类和驯化规律进行了深入探讨，揭示了亚洲栽培稻的起源和群体基因组变异结构，剖析了水稻核心种质资源的基因组遗传多样性。

2021年11月，国际半干旱热带作物研究中心和华大基因等单位合作的全球3,366份鹰嘴豆种质资源测序计划文章发表在Nature，该项目产生测序数据29T，平均测序深度12X，构建了一个较为完善的鹰嘴豆泛基因组，得到了迄今最为广泛的鹰嘴豆遗传变异图谱，揭示了鹰嘴豆的起源和驯化，阐释了基因组辅助育种方法在鹰嘴豆上的应用和实践。

此外，华大基因还和合作伙伴们利用华大自主研发的DNBSEQ测序平台完成了多个动植物种质资源的测序计划。

2019年9月，浙江大学和华大基因等单位合作的545棵银杏大树全基因组重测序项目文章发表在Nature Communications，利用DNBSEQ测序平台产出了44T的海量数据，平均测序深度6.3X，构建了非模式物种的序列变异数据库，揭示了活化石银杏种群进化历史、避难所及进化潜力。

2021年4月，华大基因和荷兰遗传资源中心等单位合作的445个生菜种质资源测序文章发表在Nature Genetics，该研究同样利用DNBSEQ测序平台产出了22T的测序数据，平均测序深度19X，全面揭示了栽培生菜的完整驯化进程，并对生菜的种质资源结构、重要农艺性状和抗病基因来源进行了探索研究，为生菜育种提供了丰富的数字化资源。

表1 上述物种相关数据汇总

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做有用的科研

助力种业振兴

随着以国产自主DNBSEQ测序平台为代表的短读长测序技术的快速发展，测序的通量和准确性都有了大幅度的提高，并且显著降低了测序成本，使开展成千上万份的大规模的动植物重测序研究成为可能。华大基因期盼与更多的合作伙伴开展大规模动植物种质资源的普查计划，共同打好种业翻身仗、加快推进种业振兴，中国人要把饭碗端在自己手里，而且要装自己的粮食。

2021年9月9日，华大基因为了使更多的合作伙伴享受到DNBSEQ测序平台的优质服务，重磅推出了9.99元起/G的测序优惠活动，为大规模动植物种质资源的普查计划提供了前所未有的好时机。

高质量自主测序平台DNBSEQ的优势

① 滚环扩增构建DNB测序文库，PCR扩增错误不会累积，高保真序列信息，测序准确性高；

② 无Index hopping之忧，结果更可靠；

③ 低Dup rate，有效数据多出3%-17%；

④ 截至2021年9月，DNBSEQ平台累计发表文章篇数达1,970+，影响因子合计8,700+，实现CNS三大主刊发文。

针对农业资源普查项目，华大基因CNS期刊主要作者及团队提供专业方案设计和专业数据分析，共同开展项目的合作研究。利用大规模种质资源普查的数据，在基因组层面开发遗传标记，研究在群体进化过程中遗传结构的变化、遗传多样性的变化、种群历史的变化、识别受到定向选择的基因、种群间基因交流情况等，还可以鉴定重要经济性状和环境适应性相关的基因，为种业振兴提供优异的基因资源。

参考文献：

1. Wang, W. et al. Genomic variation in 3,010 diverse accessions of Asian cultivated rice. Nature 557, 43–49 (2018).

2. Milner, S. G. et al. Genebank genomics highlights the diversity of a global barley collection. Nat. Genet. 51, 319–326 (2018).

3. Zhao, Y. et al. Resequencing 545 ginkgo genomes across the world reveals the evolutionary history of the living fossil. Nat. Commun. 10, 4201 (2019).

4. Juliana, P. et al. Improving grain yield, stress resilience and quality of bread wheat using large-scale genomics. Nat. Genet. 51, 1530–1539 (2019).

5. Wei T. et al. Whole-genome resequencing of 445 Lactuca accessions reveals the domestication history of cultivated lettuce. Nat. Genet. 53, 752–760 (2021).

6. Varshney, R. K. et al. A chickpea genetic variation map based on the sequencing of 3,366 genomes. Nature 599, 622–627 (2021).

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